Nel secondo quarto del secolo XVIII, l’ultimo di attività della confraternita, si pensò alle opere di abbellimento dell’interno della chiesa.
L’altare maggiore venne realizzato dallo scultore Giuseppe Rusnati (1647-1713) tra il 1710 e il 1712.

Fumagalli Carlo, Pietro Gilardi e Giovanni Antonio Castelli – S. Giovanni Battista tra l’antica e la Nuova Legge – Milano – Chiesa di S. Giovanni Decollato alle Case Rotte (ex), Gelatina ai sali d’argento su carta, 13×18, 1907, Collezione privata (link alla scheda di catalogo)

Per la decorazione della parte superiore dell’aula la Confraternita, tra il 1723 e il 1724, affidò a Giuseppe Antonio Castelli da Monza detto il Castellino (?-1724) l’esecuzione della quadratura architettonica.
La volta della navata centrale raffigurante “S. Giovanni Battista tra l’Antica e la Nuova Legge” era opera di Pietro Gilardi (1679-1730).

Fumagalli Carlo, Pietro Gilardi – Tripudio angelico – Milano – Chiesa di S. Giovanni Decollato alle Case Rotte (ex), Gelatina ai sali d’argento su carta, 13×18, 1907, Collezione privata (link alla scheda di catalogo)

Sulla volta del presbiterio venne rappresentato il “Tripudio angelico con la palma e la corona del martirio”, eseguito da Gilardi

Fumagalli Carlo, Milano – Chiesa di S. Giovanni Decollato alle Case Rotte (ex) – Interno, Nicchie sopra le porte del coro, Gelatina ai sali d’argento su carta, 13×18, 1907, Collezione privata (link alla scheda di catalogo)

Quattro statue in terracotta raffiguranti angeli, commissionate nel 1728 allo scultore Carlo Beretta,(1690-1765), furono poste nelle nicchie al di sopra delle porte del coro.

Fumagalli Carlo, Pietro Gilardi e Giuseppe Antonio Castelli – Angelo alato con putto – Milano – Chiesa di S. Giovanni Decollato alle Case Rotte (ex), Gelatina ai sali d’argento su carta, 13×18, 1907, Collezione privata

Nella parte inferiore le quadrature architettoniche furono realizzate da Antonio Castelli e da Giacomo Lecco o Lecchi o Lechi. La decorazione venne conclusa dopo il 1728.
Gli stucchi furono realizzati da Giacomo Bellotti nel 1720 e le dorature da Antonio Castino nel 1728.

Fumagalli Carlo, Giovanni Battista Sassi – Presentazione della testa ad Erode – Milano – Chiesa di S. Giovanni Decollato alle Case Rotte (ex), Gelatina ai sali d’argento su carta, 13×18, 1907, Collezione privata (link alla scheda di catalogo)

La letteratura indica in Giovanbattista Sassi (1679-1762) l’esecutore dei medaglioni sottarco e sopraporta. La decorazione della chiesa venne ultimata nel 1728.